Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcm1P70348 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm1P70348 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms