Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms