Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms