Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx6P70327 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx6P70327 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms