Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chl1P70232 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chl1P70232 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chl1P70232 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms