Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms