Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc9P70170 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc9P70170 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc9P70170 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc9P70170 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc9P70170 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Abcc9P70170 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Abcc9P70170 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Abcc9P70170 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Abcc9P70170 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc9P70170 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc9P70170 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc9P70170 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc9P70170 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc9P70170 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc9P70170 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc9P70170 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc9P70170 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc9P70170 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc9P70170 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc9P70170 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc9P70170 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc9P70170 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Abcc9P70170 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc9P70170 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc9P70170 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc9P70170 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc9P70170 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms