Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbdsP70122 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms