Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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