Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba52P62984 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms