Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms