Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms