Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms