Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms