Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrch1P62046 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms