Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmo4P61969 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms