Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg6P61406 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms