Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ActbP60710 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ActbP60710 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ActbP60710 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ActbP60710 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ActbP60710 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ActbP60710 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ActbP60710 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ActbP60710 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ActbP60710 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms