Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Romo1P60603 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms