Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia3P60469 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms