Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3eP60229 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3eP60229 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3eP60229 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms