Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl3P58873 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl3P58873 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms