Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms