Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp20P57748 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp20P57748 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms