Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Samsn1P57725 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms