Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp3P57722 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp3P57722 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms