Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NcstnP57716 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NcstnP57716 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NcstnP57716 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NcstnP57716 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NcstnP57716 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NcstnP57716 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NcstnP57716 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NcstnP57716 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms