Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace1P56818 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace1P56818 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bace1P56818 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bace1P56818 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms