Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c40P56657 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp2c40P56657 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms