Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctbp2P56546 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms