Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms