Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf5P56477 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms