Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1bbP56400 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms