Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms