Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms