Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CebpaP53566 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpaP53566 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CebpaP53566 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms