Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbtP53395 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbtP53395 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbtP53395 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbtP53395 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbtP53395 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbtP53395 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbtP53395 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DbtP53395 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DbtP53395 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DbtP53395 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DbtP53395 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DbtP53395 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DbtP53395 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DbtP53395 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms