Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms