Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RorcP51450 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RorcP51450 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RorcP51450 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RorcP51450 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RorcP51450 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RorcP51450 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RorcP51450 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RorcP51450 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RorcP51450 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RorcP51450 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RorcP51450 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RorcP51450 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RorcP51450 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms