Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfbP49766 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfbP49766 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfbP49766 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 474.6 ms