Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Mcm4P49717 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mcm4P49717 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms