Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh1P48985 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms