Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms