Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca1P48754 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca1P48754 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms