Protein–RNA interactions for Protein: P48744

Ndp, Norrin, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdpP48744 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdpP48744 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdpP48744 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdpP48744 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdpP48744 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdpP48744 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdpP48744 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdpP48744 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdpP48744 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms