Protein–RNA interactions for Protein: P48302

Ednrb, Endothelin receptor type B, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdnrbP48302 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdnrbP48302 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EdnrbP48302 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EdnrbP48302 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdnrbP48302 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdnrbP48302 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EdnrbP48302 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EdnrbP48302 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EdnrbP48302 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EdnrbP48302 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdnrbP48302 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdnrbP48302 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdnrbP48302 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdnrbP48302 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms