Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn3P48299 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Edn3P48299 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms