Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl11P48298 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms