Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl5P47962 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl5P47962 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms