Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrprbP47758 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SrprbP47758 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms